麹菌は死んでても腸活効果はあるのでしょうか？

死菌でも役割は健在です。麹菌自体が腸活に良いというよりは、麹菌の持つ酵素や、それにより生まれた栄養素が腸活をサポートしてくれます。
また、麹を使った甘酒には、便通改善効果があることの研究報告も出ています。

出典：
https://www.hakkaisan.co.jp/wp-content/uploads/2021/11/2f9862043f64f889ab4e4847706f4712.pdf